临床实践证明，直径小于3厘米的小肝癌和中晚期肝癌的治疗效果截然不同。中晚期肝癌，常伴有肝内外转移，无法手术切除，介入栓塞和药物治疗难有成效。 但早期诊断的小肝癌，手术切除、栓塞、消融等治疗方法都不错。
根据肝癌程度，一般把肝癌好发人群分为三类，第一类是高危人群，如因慢性病毒性肝炎（乙肝或丙肝）发展成肝硬化的患者；第二类是中度人群，如慢性病毒性肝炎患者，但没有肝硬化和肝癌家族史；第三类是低危人群，如非病毒性原因导致肝硬化的患者。
普查即根据三类人群进行不同检查，一般高危人群每3个月做1次相关检查（肝功、甲胎蛋白和超声）；中度人群至少每半年做1次检查；低度人群每1年做1次相关检查。查出可疑病例时，应进一步进行CT、核磁共振或动脉造影，直到排除肝癌。
手术治疗创伤大、费用高。另外，肝叶切除受肝功能状况、肝癌部位、医疗技术条件等因素影响，对肝硬化患者来说，不是一个理想的选择。
局部治疗，以射频为代表的局部治疗，创伤小、对肝脏损害轻、可反复使用，已成为小肝癌的首选治疗方法。
介入栓塞治疗，其疗效受肿瘤动脉血供制约，难以完全肝癌细胞，且对癌灶周围肝组织的病灶无明显治疗作用。
药物治疗包括化学治疗、免疫治疗、中医药治疗、基因治疗等。药物治疗只是辅助手术治疗，单独应用疗效受限。