自来水的质量要符合国家《生活饮用水卫生标准》（GB 5749 - 2006）。这个标准规定了 106 项水质指标，可以说是涵盖了饮用水中各种可能影响健康的因素。
2014 年的时候，央视报道了一条新闻，说某城市居民家中的自来水检出了抗生素阿莫西林，1 升水中含有 0.000 008 毫克。
不过，自来水中的抗生素含量并不高。1 粒阿莫西林胶囊是 500 毫克，相当于要喝 6250 万升的自来水，一辈子也喝不完。
2011 年的一次全国抽样检测结果显示，我国自来水出厂水质达标率为 83%，总体来说是安全的。
虽然自来水能够通过过滤、消毒等很多步骤的处理，对水质进行净化。但如果不注重对环境污染进行治理，那可饮用的水源将越来越少。